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10X Genomics

10X單細胞V(D)J免疫組庫測序

背景簡介



        T淋巴細胞(T cell)和B淋巴細胞(B cell)主要負責適應性免疫應答,其抗原識別主要依賴于T細胞受體(T cell recptor, TCR)和B細胞受體(B cell recptor, BCR),這兩類細胞表面分子的共同特點是其多樣性,可以識別多種多樣的抗原分子。BCR的輕鏈和TCRβ鏈由V、D、J、C四個基因片段組成,BCR的重鏈和TCRα鏈由V、J、C三個基因片段組成,這些基因片段在遺傳過程中發生重組、重排,組合成不同的形式,保證了受體多樣性。

        傳統免疫組庫研究方式局限性較大,10x Genomics新推出的“單細胞免疫譜分析”利用其微流控芯片制備單細胞體系,選擇5'端接頭的通用引物和免疫分子恒定區的巢式引物進行V(D)J富集,實現在單細胞水平,對成對的重鏈和輕鏈(B細胞)或α和β鏈(T細胞)進行全長測序,為免疫組庫全面、系統的研究提供了高效的技術平臺,對疾病發生、發展的分子機制研究有重要的意義。


 


 



技術優勢

 

可實現成對的重鏈和輕鏈(B細胞)或α和β鏈(T細胞)的全長測序

精細到單細胞水平,能獲得大量單細胞的免疫組庫數據

大規模單細胞VDJ+表達譜測序,單個細胞成本大大降低 




 


  

技術路線


 


 


 


分析內容


 


   




樣本類型


細胞懸液,組織、體液等(提供上門取樣服務)


 



代表性文章

ElhamAzizi, et al. Single-Cell Map of Diverse Immune Phenotypes in the Breast Tumor Microenvironment. Cell, 2018,DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.05.060


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