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整合分析

DNA甲基化、miRNA、mRNA整合分析

背景簡介



        DNA 甲基化是一種酶介導的化學修飾,是指在 DNA 甲基化轉移酶(DNA methytransferase, dNMT)的催化下,以 S-腺苷甲硫氨酸作為供體,將胞嘧啶轉變為 5-甲基胞嘧啶(5-methylation cyanine, 5mC)的一種反應。miRNA 是一類非編碼 RNA 分子,長度約 17-30 nt,廣泛存在于各類生物體中。miRNA通過與靶基因的 3’ -UTR 區互補配對(動物中主要機制)或與mRNA 的 body 區域近似完全互補配對(植物中主要作用機制),進而指導 miRNP 復合體對靶基因 mRNA進行翻譯抑制或剪切降解。

      miRNA、 轉錄組、甲基化組整合分析,是一個系統性雙層次聯合研究 miRNA 調控基因表達以及 DNA 甲基化調控基因表達的分子機制的方法。采用算法預測 miRNA靶基因,同時與 miRNA 表達譜、 mRNA 表達譜、 DNA 甲基化表達譜結合找到關鍵的 miRNA 及其對應的靶標基因以及兩者對應啟動子區域的甲基化水平;通過三者調控關系,構建關系網絡,從系統生物學層面探討 miRNA 參與各種復雜事件的機制。




 

  


技術路線


 




 


 


分析內容


  






樣本類型


細胞,組織,體液、血清、血漿、全血,總RNA,總DNA等

建議總RNA起始量:60 μg,最低30 μg,濃度≥400 ng/μL

建議起始量(單次):DNA>10 μg,樣品濃度>50ng/μl, OD260/OD280在1.8到2.0之間




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