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微生物組學

宏轉錄組測序


背景


        宏轉錄組學是在轉錄水平,以特定樣本中微生物群落的全部轉錄本為研究對象,分析微生物群落的基因表達與調控。宏轉錄組測序,避開了微生物的分離培養,為研究人員提供了從整體水平研究特定環境,特定時期微生物群落基因組轉錄情況以及轉錄調控規律的高效工具。



 


技術優勢


樣本處理個性化:由于微生物樣本組成復雜,將根據不同樣本特點,針對性進行樣本處理和文庫制備。

數據分析優化:精選數據拼接軟件,最大程度獲取微生物群落基因組轉錄信息。

注釋全面:采用最新版數據庫,更精確地注釋和分析微生物群落基因表達信息。

跨組學分析:從宏基因組到宏轉錄組,多個角度解析微生物群落結構與功能。





 



技術路線


 




 

 


分析內容

 

 






樣本類型


樣本類型:培養的細菌(≥ 5×106),組織,環境樣品,總RNA等

RNA總量:≥ 5 μg,濃度:≥50ng  

OD值:260/230≥1.5;260/280≥1.8

完整性(bioanalyzer2100):RIN值≥7,28S/18S≥0.7,或者峰型銳利,模擬電泳圖無彌散,5S峰顯示正常的樣品


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